После того как продавец отгрузит товары, покупатель вправе заявить «входной» НДС со всей их стоимости к вычету. В связи с этим он должен восстановить НДС с аванса, если ранее принимал его к вычету.
Минфин России в Письме от 29.02.2024 N 03-07-11/18515 отметил, что нормами Налогового Кодекса не установлена зависимость налогового периода, в котором у покупателя возникает обязанность восстановить суммы налога на добавленную стоимость, принятые к вычету в отношении оплаты, частичной оплаты, перечисленной в счет предстоящих поставок товаров, от налогового периода, в котором продавцом произведена отгрузка соответствующих товаров и в котором у продавца возникает право на вычет сумм налога на добавленную стоимость, исчисленного им с сумм оплаты, частичной оплаты, полученных в счет предстоящих поставок этих товаров.
В 2022 году ведомство высказывало иное мнение. Оно рассмотрело случай, когда продавец отгрузил товар в одном квартале, а покупатель принял его в другом. В такой ситуации покупатель должен восстановить НДС с аванса в периоде, когда была отгрузка. Этот вывод основан на позиции КС РФ.